Aktuelle Lehrveranstaltungen

Universität Potsdam - Institut für Biochemie und Biologie- AG Bioinformatics - Studium und Lehre - Lehrveranstaltungen

Sommersemester 2022

(Zeit- und Raumangaben unter Vorbehalt)

Für alle Lehrveranstaltungen benötigen Sie eine Nutzerberechtigung für die Computer Pools in Haus 25.
Antragsformular: http://www.chem.uni-potsdam.de/pools/Studierende/studierende.html

Die Lehrveranstaltungen werden auf dem E-Learning-Server der Universität (Moodle.UP) begleitet.

Lehrveranstaltungen Master Bioinformatics

Analysis of Cellular Networks (6 LP, mandatory module)

Zielgruppe:    MSBIS 1. Studienjahr (2. Semester)
Modulteile:    V/Ü (Z Nikoloski, S Hashemi Ranjbar)
Termin:           Mo. 10:15-13:45 Uhr
Ort:                  2.25.B2.01 (V) / 2.25.D2.01 (Ü) 

Introduction to Theoretical Systems Biology (6 LP, mandatory module)

Zielgruppe:    MSBIS 1. Studienjahr (2. Semester)
Modulteile:    V/Ü (W Huisinga, D Seeler)
Termin/Ort:    Mi.   08:15-09:45 Uhr, 2.05.1.06 (V)
                           Mo. 14:15-15:45 Uhr, 2.05.1.06 (Ü)

NOTE: The first lecture (April 20th) will be delivered online via Zoom. Please subscribe to the Moodle course page for login information. Thereafter, all lectures/exercises will take place on-site.

Programming Expertise  (6 LP, mandatory bridge module)

Zielgruppe:    MSBIS 1. Studienjahr (2. Semester)
Modulteile:    V/Ü (D Groth, C Kappel)
Termin:           Do. 08:15-11:45 Uhr
Ort:                   2.25.B0.01 (V) / 2.25.D0.01 (Ü)

Lectures and exercises will be given in presence but E-learning course with video materials and PDF files of the lecture slides and exercises  could be supported as well with some limitations.

Data Integration in Cellular Networks  (6 LP, elective module)

Zielgruppe:    MSBIS 2. + 4. Semester
Modulteile:    V/Ü (Z Nikoloski, M Arend, P Wendering)
Termin:           Do. 12:15-15:45 Uhr
Ort:                   2.25.B2.01 (V) / 2.25.D2.01 (Ü)

Structural Bioinformatics  (6 LP, elective module)

Zielgruppe:    MSBIS 1. Studienjahr (2. Semester)
Modulteile:    V/Ü (D Walther)
Termin:           Di. 10:15-13:45 Uhr
Ort:                   2.25.B2.01 (V) / 2.25.D2.01 (Ü)

Machine Learning in Bioinformatics  (6 LP, elective module)

Zielgruppe:    MSBIS 2. + 4. Semester
Modulteile:    V/Ü (D Groth, D Walther)
Termin:           Mi. 10:15-13:45 Uhr
Ort:                   2.25.B0.01 und D0.01 (V/Ü)

Lehrveranstaltungen Master Biochemistry and Molecular Biology

Practical Bioinformatics  (6 LP)

Zielgruppe:    MSBAM 1. Studienjahr (2. Semester)
Modulteile:    V/Ü (D Groth, P Wendering)
Termin:           Do. 14:15-16:30 Uhr
Ort:                  2.25.F0.01 (V), CIP-Pools H25 (Ü)

Programming with R (3 LP, bzw.  6 LP mit Projektarbeit)

Zielgruppe:    MSBAM 1. Studienjahr (2. Semester) , PhD-Students IBB
Modulteile:    V/Ü (D. Groth)
Termin/Ort:   September 2022

Kurs für Masterstudenten Biochemie und Molekularbiologie sowie für Doktoranden und Postdocs des IBB.

Informationen: dgroth(at)uni-potsdam(punkt)de, bzw. Telefon: +49(0)0331-977 2706

Wintersemester 2021/2022

All Lectures were switched to online courses using Zoom!

(Zeit- und Raumangaben unter Vorbehalt)

Für alle Lehrveranstaltungen benötigen Sie eine Nutzerberechtigung für die Computer Pools in Haus 25.
Antragsformular: https://www.chem.uni-potsdam.de/groups/pools/Studierende/studierende.html

Die Lehrveranstaltungen werden auf dem E-Learning-Server der Universität  (Moodle.UP) begleitet.

Lehrveranstaltungen Master Bioinformatics

Algorithmic and Mathematical Bioinformatics  (6 LP, mandatory module)

Zielgruppe:   MSBIS 1. Studienjahr (1. Semester)
Modulteile:    Vorlesung und Übung (Z Nikoloski)
Termine:        Mo. 10:15-13:45
Ort:                  Online

Introduction to databases and practical programming  (6 LP,  bridge module)

Zielgruppe:    MSBIS 1. Studienjahr (1. Semester) , MSBIS 2. Studienjahr (3. Semester)
Modulteile:     Vorlesung und Übung (D. Groth)
Termine:         Fr. 8:15-11:45 (D. Groth)
Ort:                   Online

Statistical Bioinformatics (6 LP, mandatory module)

Zielgruppe:    MSBIS 1. Studienjahr (1. Semester)
Modulteile:     Vorlesung und Übung (D Groth, D Walther)
Termine:         Mi. 10:15-13:45
Ort:                    Online

Constraint-based Modeling of Cellular Networks (6 LP, mandatory module)

Zielgruppe:     MSBIS 1. Studienjahr (1. Semester) und MSBIS 2. Studienjahr (3. Semester)
Vorlesung:       Constraint-based Modeling of Cellular Networks
Modulteile:      Vorlesung und Übung ( Z Razaghi-Moghadam, Z. Nikoloski)
Termin:             Di. 10:15-15:45
Ort:                    Online

Bioinformatics of Biological Sequences (6 LP, mandatory module)

Zielgruppe:    MSBIS 1. Studienjahr (1. Semester) , MSBIS 2. Studienjahr (3. Semester)
Modulteile:     Vorlesung und Übung (S Hartmann)
Termine:         Di. 8:15-11:45 (S Hartmann)
Ort:                   Online

State of the Art in Biochemistry and Molecular Biology (6 LP,  bridge module)

Zielgruppe:    MSBIS 1. Studienjahr (1. Semester) , MSBIS 2. Studienjahr (3. Semester)
Modulteile:     Ringvorlesung (M Grebe, B Müller-Röber uvm.)
Termine:         Mi. 16:15-17:45 , Do. 16:15-17:45, Fr. 14:15-16:45 (M Grebe, B Müller-Röber uvm.)
Ort:                   Mi. + Fr. :Online, Do.: gr. Chemie-Hörsaal 2.27

Quantitative Genetics (6 LP, elective module)

Zielgruppe:    MSBIS 2. Studienjahr (3. Semester)
Modulteile:     Vorlesung und Übung (M Lenhard, Z Nikoloski)
Termine:         Mi. 12:15-15:45
Ort:                   Online

Bioimage Analysis and Extended Phenotyping (6 LP, elective module)

Zielgruppe:    MSBIS 2. Studienjahr (3. Semester)
Modulteile:     Vorlesung, Übung  + Block(C Kappel)
Termine:         Fr. 9:15-11:45
Ort:                   Online

Sommersemester 2021

All Lectures were switched to online courses using Zoom!

(Zeit- und Raumangaben unter Vorbehalt)

Für alle Lehrveranstaltungen benötigen Sie eine Nutzerberechtigung für die Computer Pools in Haus 25.
Antragsformular: http://www.chem.uni-potsdam.de/pools/Studierende/studierende.html

Die Lehrveranstaltungen werden auf dem E-Learning-Server der Universität begleitet.

Lehrveranstaltungen Master Bioinformatics

Analysis of Cellular Networks (6 LP, mandatory module)

Zielgruppe:    MSBIS 1. Studienjahr (2. Semester)
Modulteile:    V/Ü (Z Nikoloski, N Omranian)
Termin:           Mo. 10:15-13:45 Uhr
Ort:                   2.14.3.02 (V/Ü) 

Introduction to Theoretical Systems Biology (6 LP, mandatory module)

Zielgruppe:    MSBIS 1. Studienjahr (2. Semester)
Modulteile:    V/Ü (W Huisinga, D Seeler)
Termin/Ort:    Mi.   08:15-09:45 Uhr, 2.28.0.104 (V)
                           Mo. 14:15-15:45 Uhr, 2.14.3.02 (Ü)

Programming Expertise  (6 LP, mandatory bridge module)

Zielgruppe:    MSBIS 1. Studienjahr (2. Semester)
Modulteile:    V/Ü (D Groth, C Kappel)
Termin:           Do. 08:15-11:45 Uhr
Ort:                   2.25.B0.01 (V) / 2.25.D0.01 (Ü)

Structural Bioinformatics  (6 LP, elective module)

Zielgruppe:    MSBIS 1. Studienjahr (2. Semester)
Modulteile:    V/Ü (D Walther)
Termin:           Di. 10:15-13:45 Uhr
Ort:                   2.25.B0.01 (V) / 2.25.D0.01 (Ü)

Data Integration in Cellular Networks  (6 LP, elective module)

Zielgruppe:    MSBIS 2. + 4. Semester
Modulteile:    V/Ü (Z Nikoloski, Z Razaghi-Moghadam)
Termin:           Do. 12:15-15:45 Uhr
Ort:                   2.14.3.02 (V/Ü)

Machine Learning in Bioinformatics  (6 LP, elective module)

Zielgruppe:    MSBIS 2. + 4. Semester
Modulteile:    V/Ü (D Groth, D Walther)
Termin:           Mi. 10:15-13:45 Uhr
Ort:                   2.25.B0.01 und D0.01 (V/Ü)

Lehrveranstaltungen Master Biochemistry and Molecular Biology

Practical Bioinformatics  (6 LP)

Zielgruppe:    MSBAM 1. Studienjahr (2. Semester)
Modulteile:    V/Ü (D Groth, P Wendering)
Termin:           Do. 14:15-16:30 Uhr
Ort:                  2.25.F0.01 (V), CIP-Pools H25 (Ü)

Programming with R (3 LP, bzw.  6 LP mit Projektarbeit)

Zielgruppe:    MSBAM 1. Studienjahr (2. Semester) , PhD-Students IBB
Modulteile:    V/Ü (D. Groth)
Termin/Ort:   September 2021, 21.9.-23.9 und 28.9.-29.9. (Zoom)

Kurs für Masterstudenten Biochemie und Molekularbiologie sowie für Doktoranden und Postdocs des IBB. Informationen: dgroth(at)uni-potsdam(punkt)de, bzw. Telefon: +49(0)0331-977 2706

Wintersemester 2020/2021

Zeit- und Raumangaben unter Vorbehalt.

Einschreibungen über PULS: 01.10.2020 bis 15.11.2020

Für einige Lehrveranstaltungen benötigen Sie eine Nutzerberechtigung für die Computer Pools in Haus 25.
Informationen zu den Pools und Link zum Antragsformular für einen Pool-Account

Die Lehrveranstaltungen werden auf dem E-Learning-Server der Universität begleitet. der Zugang dazu erfolgt mit Hilfe des E-Mail Accounts der Universität.

Algorithmic and Mathematical Bioinformatics  (6 LP)

Zielgruppe:   MSBIS 1. Studienjahr (1. Semester)
Modulteile:    Vorlesung und Übung (Z Nikoloski)
Termine:        Mo. 10:15-13:45
Ort:                  Online

Introduction to databases and practical programming  (6 LP)

Zielgruppe:    MSBIS 1. Studienjahr (1. Semester) , MBINFO 2. Studienjahr (3. Semester)
Modulteile:     Vorlesung und Seminar (D. Groth)
Termine:         Di. 10:15-13:45 (D. Groth)
Ort:                   Online

Statistical Bioinformatics (6 LP)

Zielgruppe:    MSBIS 1. Studienjahr (1. Semester)
Modulteile:     Vorlesung und Übung (D Groth, D Walther)
Termine:         Mi. 10:15-13:45
Ort:                    Online

Quantitative Genetics (6 LP)

Zielgruppe:    MSBIS 2. Studienjahr (3. Semester)
Modulteile:     Vorlesung und Übung (M Lenhard, Z Nikoloski)
Termine:         Mi. 12:15-15:45
Ort:                   Online

Constraint-based Modeling of Cellular Networks (6 LP)

Zielgruppe:     MSBIS 1. Studienjahr (1. Semester) und MBINFO 2. Studienjahr (3. Semester)
Vorlesung:       Constraint-based Modeling of Cellular Networks
Modulteile:      Vorlesung und Übung (R Moghadam, Z. Nikoloski)
Termine/Ort:   Vorlesung: Di. 10:15-11:45 Uhr (Online)
                              Übung: Do. 12:15-13:45 (Online)

Sommersemester 2020

All Lectures were switched to online courses using Zoom!

(Zeit- und Raumangaben unter Vorbehalt)

Für alle Lehrveranstaltungen benötigen Sie eine Nutzerberechtigung für die Computer Pools in Haus 25.
Antragsformular: http://www.chem.uni-potsdam.de/pools/Studierende/studierende.html

Die Lehrveranstaltungen werden auf dem E-Learning-Server der Universität begleitet.

Lehrveranstaltungen Master Bioinformatics

Analysis of Cellular Networks (6 LP, mandatory module)

Zielgruppe:    MSBIS 1. Studienjahr (2. Semester)
Modulteile:    V/Ü (Z Nikoloski, N Omranian)
Termin:           Mo. 10:15-13:45 Uhr
Ort:                   2.14.3.02 (V/Ü) 

Introduction to Theoretical Systems Biology (6 LP, mandatory module)

Zielgruppe:    MSBIS 1. Studienjahr (2. Semester)
Modulteile:    V/Ü (W Huisinga, D Seeler)
Termin/Ort:    Mi.   08:15-09:45 Uhr, 2.28.0.104 (V)
                           Mo. 14:15-15:45 Uhr, 2.14.3.02 (Ü)

Programming Expertise  (6 LP, mandatory bridge module)

Zielgruppe:    MSBIS 1. Studienjahr (2. Semester)
Modulteile:    V/Ü (D Groth, C Kappel)
Termin:           Do. 08:15-11:45 Uhr
Ort:                   2.25.B0.01 (V) / 2.25.D0.01 (Ü)

Structural Bioinformatics  (6 LP, elective module)

Zielgruppe:    MSBIS 1. Studienjahr (2. Semester)
Modulteile:    V/Ü (D Walther)
Termin:           Di. 10:15-13:45 Uhr
Ort:                   2.25.B0.01 (V) / 2.25.D0.01 (Ü)

Data Integration in Cellular Networks  (6 LP, elective module)

Zielgruppe:    MSBIS 2. + 4. Semester
Modulteile:    V/Ü (Z Nikoloski, Z Razaghi-Moghadam)
Termin:           Do. 12:15-15:45 Uhr
Ort:                   2.14.3.02 (V/Ü)

Machine Learning in Bioinformatics  (6 LP, elective module)

Zielgruppe:    MSBIS 2. + 4. Semester
Modulteile:    V/Ü (D Groth, D Walther)
Termin:           Mi. 10:15-13:45 Uhr
Ort:                   2.25.B0.01 und D0.01 (V/Ü)

Lehrveranstaltungen Master Biochemistry and Molecular Biology

Practical Bioinformatics  (6 LP)

Zielgruppe:    MSBAM 1. Studienjahr (2. Semester)
Modulteile:    V/Ü (D Groth, P Wendering)
Termin:           Do. 14:15-16:30 Uhr
Ort:                  2.25.F0.01 (V), CIP-Pools H25 (Ü)

Programming with R (3 LP, bzw.  6 LP mit Projektarbeit)

Zielgruppe:    MSBAM 1. Studienjahr (2. Semester) , PhD-Students IBB
Modulteile:    V/Ü (D. Groth)
Termin/Ort:   1x5 Tage in 2 Wochen im September 2020
21.-25.09.2020 (V/Ü) 2.14.3.02
Kurs für Masterstudenten Biochemie und Molekularbiologie sowie für Doktoranden und Postdocs des IBB. Informationen: dgroth(at)uni-potsdam(punkt)de, bzw. Telefon: +49(0)0331-977 2706