In FloDeMEc gehören alle großen Flussgebietsdistrikte Elbe, Donau, Maas, Oder, Ostseezuflüsse, Rhein und Weser mit ihren Flüssen zur Untersuchungskulisse. Mit Hilfe detaillierterer hydrologischer Einheiten werden entlang eines Flusses Auenbereiche einem Pegel zugeordnet. An Pegeln werden Abflüsse gemessen, die dann zu Hochwassern mit bestimmter Auftrittswahrscheinlichkeit zugewiesen werden.

Für 13 der 16 Bundesländer  wurden mit Hilfe der Hochwassergefahrenkarten Auengrenzen verglichen.